Демократизация исследований биоразнообразия

за счет неправильного использования портативного секвенатора с длинным считыванием для штрихкодирования с коротким считыванием Многие виды животных на Земле ждут открытия и описания, но найти все эти неизвестные виды монументальная задача. Здесь мы обсуждаем, как MinION, доступный портативный секвенатор, может ускорить процесс открытия новых видов, и предлагаем этот инструмент для крупномасштабного открытия биоразнообразия по всей планете.

Наша статья , расширяющая то, что мы здесь обсуждаем, опубликована Список электронной почты отрасли сегодня в журнале Biology . Рудольф Мейер, Амрита Шриватсан и Эмили Хартоп 4 декабря 2019 г. Большая часть неописанного биоразнообразия состоит из бесчисленного множества мелких организмов, принадлежащих к миллионам видов. Это затрудняет поиск новых и редких видов в образцах, которые часто содержат тысячи организмов например, в массовых образцах насекомых.



Одним из решений является использование последовательностей ДНК для сортировки образцов на предполагаемые виды с использованием высокопроизводительных методов обратный рабочий процесс . К сожалению, для этого обычно требуются дорогостоящие централизованные средства секвенирования, которые недоступны в некоторых регионах Земли с наибольшим биоразнообразием. MinION, доступный портативный секвенсор с питанием от USB,